Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Msx2Q03358 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms