Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms