Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sec23aQ01405 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sec23aQ01405 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sec23aQ01405 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23aQ01405 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Sec23aQ01405 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Sec23aQ01405 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sec23aQ01405 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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