Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms