Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gjb2Q00977 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms