Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms