Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ElocP83940 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ElocP83940 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ElocP83940 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms