Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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