Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx2P80206 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms