Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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