Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms