Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rab3cP62823 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab3cP62823 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rab3cP62823 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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