Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23aP62751 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23aP62751 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms