Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms