Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rin3P59729 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rin3P59729 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rin3P59729 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rin3P59729 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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