Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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