Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf5P56477 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms