Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NcanP55066 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NcanP55066 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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