Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms