Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gbx2P48031 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gbx2P48031 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms