Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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