Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtlP38585 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtlP38585 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TtlP38585 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms