Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddit3P35639 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddit3P35639 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms