Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms