Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VtnP29788 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VtnP29788 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms