Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms