Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms