Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P20040 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P20040 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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