Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18528 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18528 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18528 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms