Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.6 ms