Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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