Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DmdP11531 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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DmdP11531 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DmdP11531 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DmdP11531 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DmdP11531 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DmdP11531 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DmdP11531 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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DmdP11531 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DmdP11531 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DmdP11531 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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