Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Becn2P0DM65 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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