Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms