Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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