Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setdb1O88974 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setdb1O88974 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setdb1O88974 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setdb1O88974 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms