Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Serf1O88892 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms