Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms