Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EdaO54693 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EdaO54693 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms