Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms