Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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