Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kcnk3O35111 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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