Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms