Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms