Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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