Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc180J3QNE4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms