Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm17535J3KMR8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17535J3KMR8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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