Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17455G3UW87 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17455G3UW87 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms