Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LctF8VPT3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms