Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm28048F7BCN0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm28048F7BCN0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm28048F7BCN0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm28048F7BCN0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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